Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRM3Q9NNZ6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms