Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPM3Q9HCF6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms