Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ELL3Q9HB65 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms