Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 MED20-203ENST00000409060 815 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC092810.1-201ENST00000429208 1224 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AL357093.1-201ENST00000556926 458 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SENP3Q9H4L4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms