Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2M9

RAB3GAP2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP2Q9H2M9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB3GAP2Q9H2M9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms