Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHARPINQ9H0F6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms