Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SEMA4CQ9C0C4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms