Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NIFKQ9BYG3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms