Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCGF6Q9BYE7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms