Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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