Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTDSS2Q9BVG9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms