Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MTA3Q9BTC8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms