Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms