Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms