Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms