Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USB1Q9BQ65 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms