Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFRSF13CQ96RJ3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms