Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms