Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms