Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms