Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MALSU1Q96EH3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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