Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD2Q96BF3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms