Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RFT1Q96AA3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms