Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRIM63Q969Q1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TRIM63Q969Q1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM63Q969Q1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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