Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM54Q969K7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM54Q969K7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms