Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF34Q969K3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms