Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms