Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TOPBP1Q92547 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms