Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC12Q8WUD4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC12Q8WUD4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms