Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms