Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNDC9Q8TBE3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms