Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF548Q8NEK5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
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