Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE23Q8NDY6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BHLHE23Q8NDY6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms