Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KBTBD3Q8NAB2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms