Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DTX3Q8N9I9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms