Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6S4

ANKRD13C, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13CQ8N6S4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD13CQ8N6S4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms