Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC82Q8N4S0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms