Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
P3H3Q8IVL6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
P3H3Q8IVL6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
P3H3Q8IVL6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
P3H3Q8IVL6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
P3H3Q8IVL6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
P3H3Q8IVL6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
P3H3Q8IVL6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
P3H3Q8IVL6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
P3H3Q8IVL6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
P3H3Q8IVL6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
P3H3Q8IVL6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC29■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
P3H3Q8IVL6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
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