Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNMB4Q86W47 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNMB4Q86W47 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms