Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6L0

PRRT2, Proline-rich transmembrane protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT2Q7Z6L0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRT2Q7Z6L0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
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