Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PREX2Q70Z35 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms