Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FAM43BQ6ZT52 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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