Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms