Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms