Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCD3Q6STE5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMARCD3Q6STE5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms