Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOA5Q6Q788 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.32■■□□□ 1
APOA5Q6Q788 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms