Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI97

C11orf88, UPF0722 protein C11orf88, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf88Q6PI97 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C11orf88Q6PI97 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms