Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms