Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms