Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNS3Q68CZ2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNS3Q68CZ2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms